Cenicaña genera tecnología para asegurar a la industria azucarera colombiana su competitividad y rentabilidad. Con base en las prioridades tecnológicas de la industria, el Centro desarrolla programas de investigación y cuenta con servicios de apoyo a la investigación. La dirección y administración de Cenicaña están conformadas por los órganos directivos (sala general, junta directiva, dirección general).