La Estación Experimental está ubicada en el corregimiento de San Antonio de los Caballeros (Florida, Valle del Cauca), donde se encuentran las oficinas de administración e investigación, la biblioteca, los invernaderos y los laboratorios.
La estación ocupa 62 hectáreas localizadas a 3° 21′ de latitud norte, 76° 18′ de longitud oeste y 1024 metros sobre el nivel del mar. La temperatura media anual en este sitio es de 23.3 °C, precipitación media anual de 1135 mm y humedad relativa de 80% (datos a abril de 2016).